第1部分第2部分第3部分
小引卷之一医学源流第一中风第二虚痨第三咳嗽第四疟疾第五痢症第六心腹痛胸痹第七隔食反胃第八气喘第九血症第十水肿第十一卷之二胀满蛊胀第十二(水肿参看)暑症第十三泄泻第十四眩晕第十五呕哕吐第十六(呃逆附)癫
序序刻孙真人眼科秘诀序卷之一孙真人眼科总理七十二症秘诀冲和汤玄灵圣方制炉甘石药开明汤十大将军冲翳散揭障丹十二将军二圣散论二圣散扫雾丹制蕤仁之法大决明散赛宝丹调合赛宝丹法补脑还精丸外治烂弦迎风有泪方卷之
卷首序奏玉帝青辞进医书表卷上当明经络须识扶阳住世之法大病宜灸三世扁鹊时医三错忌用转下禁戒寒凉要知缓急五等虚实黄帝灸法扁鹊灸法附∶窦材灸法卷中伤寒伤寒四经见证太阳见证阳明见证太阴见证少阴见证伤风伤寒挟食
自序凡例卷一月经治月经病方卷二胎前治胎前病方秦氏世传逐月养胎方卷三小产治小产病方临产治临产病方附前人治临产效方卷四产后治产后病方卷五带下治滞下病方崩漏治崩漏病方附录前人治临产效方卷六妇女杂病治妇女杂病
概述卷一阴阳颠倒篇顺逆探原篇回天生育篇天人寿夭篇命根养生篇救母篇红铅损益篇初生微论篇骨阴篇卷二媾精受妊篇社生篇天厌火衰篇经脉相行篇经脉终始篇经气本标篇脏腑阐微篇考订经脉篇包络配腑篇卷三胆腑命名篇任督死
序总论伤寒总诀治法太阳经伤寒太阳经伤风阳明经分在经在腑阳明经经病阳明经腑病少阳经主中宜和解三阴经分传经直中太阴经传经热症太阴经直中寒症少阴经传热症少阴经直中寒症厥阴经传经热症厥阴经直中寒症结胸血结胸痞
正文种痘要旨选苗蓄苗天时择吉调摄禁忌可种不可种水苗种法五脏传送之理旱苗种法痘衣种法痘浆种法信苗补种自出治法
本事方续集
自序卷之一痈疽门痈疽原委论第一痈疽治法总论第二痈疽阳症歌第三痈疽阴症歌第四痈疽半阴半阳症歌第五痈疽五善歌第六痈疽七恶歌第七治病则例歌第八痈疽灸法并禁灸疮穴第九论病生死法第十察形色顺逆第十一病有三因受病