序序论第一果实第二（二十九条）菜蔬第三（五十八条）谷米第四（二十七条）鸟兽第五（四十条）
序小引卷一望色一望色二望色三闻声问症切脉五脏平脉男女异脉无病经脉脉分四时六气七怪脉歌八脉该二十八字脉象节录病机赋脉有宜忌妇人脉法小儿脉法中风痨症附录慎柔五书卷二肿消水圣愈汤辛附子汤胀臌症六君子汤噎膈反
序新刻药鉴卷之一寒热温平四赋，增补东垣未尽之意药性（寒门）药性（热门）药性（温门）药性（平门）新刻药鉴卷之一用药分根梢制药资水火用药丸散例解药毒法用药生熟法药性阴阳论病症标本论取方之法论各经补泻及专主
神农本草经赞
序一序二序三卷之一一辨气二辨色三辨舌辨传经夹血夹脾虚夹肾虚夹亡血夹疝夹心胃痛夹哮喘卷之二表证发热恶寒寒热往来头痛头眩头胀头重目胀项强酸背痛酸腰痛酸膝痛酸胫腿痛酸足痛肩臂痛酸腕痛周身骨节酸痛身重自汗盗汗
叙卷一·琼瑶神书天部宋徽宗皇帝崇宁五年琼瑶真人一书手法序一琼瑶真人用升阳升阴气上气下之手法讲论歌二琼瑶标本运气歌三琼瑶辨十二经水火分治法四宋徽宗崇宁皇帝论五论手足阴阳流注篇六络脉传注周流不息七琼瑶真人
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铜人鍼灸经
脚气治法总要
黄帝内经素问遗篇